IP: Carracedo Álvarez, Ángel
Entidad de realización: Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica
Entidad/es financiadora/s: Gobierno de España – ISCIII
Fecha de inicio-fin: 2020 – 2022
Los TEA son trastornos complejos que involucran factores de riesgo tanto ambientales como genéticos. Hasta el momento, se han identificado cientos de genes de susceptibilidad al TEA aunque a pesar de los esfuerzos invertidos en este campo, se estima que una fracción importante de la arquitectura poligénica del TEA permanece sin ser descubierta.
Los principales objetivos de este proyecto colaborativo con el equipo del Hospital Universitario Gregorio Marañón, liderado por el Dr. Celso Arango (PI19/01024) son:
1) desentrañar la arquitectura poligénica del TEA, incluyendo variación genética común, variación rara en regiones reguladoras no codificantes, estudio de ADN mitocondrial, en colaboración con PI17/00819 and PI17/01926 y variación estructural
2) caracterización funcional de los nuevos hallazgos genéticos utilizando modelos celulares de iPSCs derivadas de pacientes y modelos de pez cebra
3) definir e implementar algoritmos diagnósticos basados en la evidencia teniendo en cuenta el costo-beneficio.
Para conseguir estos objetivos pretendemos realizar un estudio GWAS en 1300 pacientes con TEA y 4000 controles y exploraremos variaciones en regiones reguladoras en 300 trios con resultados negativos para microarrays y secuenciación de exomas.
Para ver la relación con TEA de genes novedosos realizaremos ensayos celulares de iPSCs derivados de pacientes y modelos de pez cebra. Usaremos CRISPR-Cas9 en ambos modelos para la edición genómica de las iPSCs y los modelos de pez cebra. Con la información genética obtenida y la información fenotípica asociada, realizaremos estudios de coste-eficiencia para diseñar árboles de decisión diagnóstica.
